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据美国媒体报道,XBB.1.5已成为美国“头号流行毒株”,占美国新冠肺炎病例的41%。新冠肺炎的不断突变和进化也引起了人们的关注。让我们一起来了解一下XBB.1.5作为美国与Tengyue.com的“头号流行毒株”,以及奥米克隆变异的最新消息。
XBB.1.5成为美国“头号流行毒株”
新冠肺炎的变异毒株仍在进化,免疫逃逸能力最强的Omicron亚型毒株XBB.1.5成为美国排名第一的流行毒株。
上周六,据媒体报道,根据CDC公布的最新数据,XBB.1.5占本周美国新冠肺炎病例的41%,已经取代BQ.1.1和BQ.1占据主导地位。
值得一提的是,XBB.1.5在过去一周迅速崛起,感染率几乎翻倍。截至12月24日的一周,XBB.1.5的感染率为21.7%。
起初,XBB突变株最早于8月在印度发现,随后迅速传播,很快成为新加坡、马来西亚等国的主要流行毒株。此后,XBB突变体逐渐演变为Omikjonya的分支,包括XBB.1和XBB.1.5
指出XBB的致病性并没有明显增强,但由于该菌株的突变能更好地与人体细胞受体结合,XBB.1.5具有更高的免疫逃逸能力。此外,新冠肺炎的中和抗体如Regeneron和Lilly对XBB已经完全无效,加强针的疗效也有所下降,但针对保守靶点的小分子药物仍保持其疗效。
XBB能更好的与细胞结合,逃逸能力更强
最新研究表明,XBB.1.5的致病性没有明显增强,与BA.2.75相似或更低,但其关键突变F486P能更好地与人体细胞结合,更容易感染人。
约翰霍普金斯大学病毒学家安德鲁·佩科兹(Andrew Pekosz)表示,XBB.1.5与其他Omicron变异体不同,多了一个突变F486P,对人类ACE2受体的亲和力更强,可以更好地与细胞结合,更容易进入人体。
北京大学生物医学研究员曹云龙在推特上发布的数据显示,XBB.1.5不仅可以像XBB.1变体一样有效地逃避抗体保护,而且前者具有很高的免疫逃避能力,更善于通过关键受体与细胞结合。
增强针头的保护作用和降低针对保守靶点的小分子药物的保护作用仍然有效
在本月早些时候发表在《细胞》杂志上的一项研究中,哥伦比亚大学的科学家警告说,XBB等亚变异体的增加可能会进一步破坏当前新冠肺炎疫苗的保护效力,导致突破性感染和再感染的激增。
结果表明,在至少两剂mRNA疫苗的条件下,突破BF.7的感染不能诱导出高水平的抗XBB.1和XBB.1.5的中和抗体,难以防止再感染。XBB变异体比BQ变异体能更有效地逃避加强针的保护,这两种变异体是迄今为止逃避疫苗保护能力最强的变异体。
根据NEJM杂志的数据,在美国上市的中和抗体(阿斯利康、葛兰素史克/Vir、礼来、Regeneron)对BQ.1.1和XBB完全无效,只有针对保守靶点的小分子药物Remdesivir(吉利德)、Nematway(辉瑞)和Monola(默克)仍保持疗效。
此前,拜登政府的首席医疗顾问福奇曾表示,XBB亚型可能会降低对针头的保护。傅琦说,新加坡感染XBB的人数大幅增加,但住院人数并没有以同样的速度增加。XBB.1.5加假期旅行可能会导致美国的病例增加,但加强针似乎对预防重症更有效。
在中国已经检测到XBB突变体,但优势传播尚未形成
目前上海已检出XBB.1.5株,这些病例多为境外输入性病例,处于闭环分离管理,因此未造成BQ.1家族和XBB家族的本地大规模传播。
CDC此前指出,Omicron中的BQ.1和XBB分支已引入中国,其利差优势将逐渐增大。
据中国疾控中心病毒学研究所所长徐文伯介绍,近三个月来,我国已检出BF.7、BQ.1、XBB,奥米克隆130多个亚支输入我国。同时,这50个支行均引起了相关的本地病例或疫情,包括BQ.1和XBB,其中BQ.1及其支行在9个省份检出49例,在3个省份检出11例。整个BQ.1和XBB在国内还没有形成主导传播(目前以BA.5.2和BF.7为主),但传播优势会逐渐增加,可能会与BA.5.2和BF.7,以及其他50个以上输入的子分支形成共循环。
上海的菌株集中在五个亚系中
为评估奥米克隆株在中国的传播方式、疫情防控措施调整后中西部大城市和农村可能出现的症状重症患者比例以及本次疫情的趋势,近日,上海交通大学医学院附属瑞金医院、转化医学国家重点基础设施(上海)陈赛娟团队、上海公共卫生临床中心范晓红团队联合攻关。研究论文《中国2022年秋冬季新冠肺炎疫情奥米克隆亚型多样性及流行病学特征初步分析》发表在《前沿医学》上,该论文分析了中国目前流行的奥米克隆亚型类型、感染者和住院患者中重症/危重患者的比例,并通过数学建模模拟预测了疫情趋势。
研究团队从2022年秋冬季在上海市公共卫生中心就诊的患者中随机抽取378份样本进行基因组测序,获得了369条高质量的新冠肺炎基因组序列。分子系统进化树分析显示,这些病毒的基因组包含全球共享所有流感数据倡议的数据库中记录的30个Omicron亚型毒株,其中355个(95.95%)基因组序列集中在5个奥美毒株中。主要菌株包括北京和广州已报道流行的BF.7、BA.5.2、最近在欧美出现的BQ.1和XBB。在这些结果中没有发现新的新冠肺炎突变体。
随着疫情防控任务向以重症病例防治为重点转变,课题组分析了本次疫情截至2022年11月29日的重症/危重病例数和总感染人数的变化,发现重症/危重病例数随着感染人数的增加而增加,比例达到0.035%。按照一般规律,高危人群会在住院2到3周后成为重症/危重症患者。因此,研究小组分析了2022年9月1日至2022年12月26日在上海公共卫生中心接受治疗的5706名有症状的新冠肺炎感染患者的临床演变情况。经综合医学观察和诊断,5533例患者表现为轻、普通型(占总数的96.97%),其余173例患者进展为重症/危重型(占总数的3.03%)。此外,老年人(55-60岁以上,P < 0.0001)和男性患者(P < 0.0001)患严重/危重疾病的风险明显更高。
课题组对近期疫情发展趋势进行了评估和预测,初步判断北京、广州、上海、重庆等地2023年元旦前后此轮奥米克隆疫情感染人数接近尾声。对于四川、陕西、甘肃、青海等省份,在除省会城市以外的人群中预测了疫情进展。预计农村和中小城市地区的感染高峰将出现在2023年1月中下旬,由于春运高峰,这些高峰也可能提前到来。因此,课题组建议,急需启动奥米克隆疫情向农村蔓延的应急预案,将更多医疗资源配置到农村基层。
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