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研究报告和学术论文在内容要求上有一些区别。总的来说，论文言简意赅，只突出一个研究工作最重要、最精彩、最有创意的内容。论文包含新的见解或形成新的解释、新的论点、新的理论，没有对一般研究过程的描述，也没有过多的具体材料；科研报告可以包括整个研究工作的重要过程、方法和环节。
研究报告和学术论文在创新上是有区别的。在创新方面，学术论文必须在充分占有大量文献资料的基础上提出新的观点和理论，以补充现有研究的不足，纠正流行说法的偏差，填补研究的空白，达到现有研究的新高度；但研究报告重在陈述研究过程的事实和数据，说明问题，不一定要有创新观点的形成。
研究报告和学术论文在论证过程中是有区别的。就论证过程而言，学术论文是在论证的基础上写成的。论文作者应使用严谨规范的科学语言、形式和专业术语概念阐述自己的观点，论证提出的理论模型，做到实事求是，令人信服，论证深刻充分，论证严谨透彻，论证准确公正，论据可靠确凿，推理成分高，理论合理性强。研究报告侧重于用事实和数据来解释和揭示某个问题或现象，主要依靠事实和数据。
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